Стипендії Президента України для молодих вчених призначаються з метою підтримки молодих вчених Національної академії наук, які проводять перспективні наукові дослідження в галузі природничих, технічних, суспільних і гуманітарних наук. Згідно з Указом Президента України від 22.03.1994 № 100/94 "Про державну підтримку наукової діяльності Академії наук України" (зі змінами) засновано 300 щомісячних стипендій, які призначаються за рішенням Комітету з Національної премії України імені Бориса Патона (Комітет).
Відповідно до Положення про стипендії Президента України для молодих вчених, затвердженого постановою Кабінету Міністрів України від 23.08.1994 № 582 (зі змінами), стипендії присуджуються на конкурсних засадах терміном на два роки.
На здобуття стипендій можуть висуватися аспіранти, наукові працівники науково-дослідних інститутів та інших наукових установ, організацій, підприємств НАН України, що відповідають визначенню терміна «молодий вчений», наведеному у Законі України «Про наукову і науково-технічну діяльність». Зокрема, вік молодого вченого, який має вищу освіту не нижче другого (магістерського) рівня, не може перевищувати 35 років включно, та вченого, який має науковий ступінь доктора наук – 40 років включно.
Висунення осіб на здобуття стипендій Президента України здійснює вчена (наукова, науково-технічна, технічна) рада організації за місцем основної роботи (навчання) зазначених осіб у разі наявності письмових рекомендацій не менше двох докторів наук, особисто обізнаних з науковими досягненнями та здібностями молодого вченого.
Президія НАН України двічі на рік (до 25 квітня і 25 жовтня) за результатами конкурсного відбору, що проводиться відповідно до Порядку проведення конкурсу на здобуття стипендій Президента України для молодих вчених, затвердженого постановою Президії НАН України від 31.08.2022 № 258, передає Комітетові рекомендації щодо призначення стипендій на поточні вакансії.
Рада організації, де працює (навчається) стипендіат, двічі на рік здійснює атестацію його наукової роботи і надсилає короткий звіт про досягнуті ним результати до Президії НАН України.
Виплата стипендії може бути припинена Комітетом за поданням вченої ради організації, що висувала стипендіата, погодженим з Президією НАН України. Виплата стипендії також припиняється після досягнення стипендіатом граничного для молодих вчених віку.
Розмір стипендії встановлено постановою Кабінету Міністрів України від 26.09.2002 № 1462 (зі змінами) та становить три прожиткових мінімуми для працездатних осіб.